Zusammenfassung
In diesem Kapitel lernen wir:
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die Hauptquellen von Fehlern in einem Hochdurchsatz-Screening zu identifizieren und Lösungen für diese Probleme vorzuschlagen.
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zu bestimmen, ob ein HTS-System für das Screening einer Mutantenbibliothek geeignet ist.
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die Daten aus einem HTS zu analysieren und darzustellen.
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Mittelwert, Standardabweichung und Variationskoeffizient aus einem Datensatz zu berechnen.
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den Unterschied zwischen einem scheinbaren Variationskoeffizienten und einem wahren Variationskoeffizienten zu verstehen.
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das HTS-System anzupassen, wenn sich die Proteinvarianten verbessern.
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Weiterführende Literatur
Hermann R, Lehmann M, Buchs J (2003) Characterization of gas-liquid mass transfer phenomena in microtiter plates. Biotechnol Bioeng 81(2):178–186
Kong F, Yuan L, Zheng YF, Chen W (2012) Automatic liquid handling for life science: a critical review of the current state of the art. J Lab Autom 17(3):169–185
Trask OJ (2018) Guidelines for microplate selection in high content imaging. Methods Mol Biol 1683:75–88
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Übung
Übung
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a)
Berechnen Sie den Mittelwert, die Standardabweichung und den Variationskoeffizienten der drei internen Kontrollen von Bibliotheksplatte A (Fig. 9.14).
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b)
Wiederholen Sie die Berechnungen für die Bibliotheksplatte B.
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c)
Welche Informationen können Sie aus den Berechnungen in (a) und (b) ableiten?
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d)
Können Sie einen Randeffekt bei den Bibliotheksplatten feststellen? Begründen Sie Ihre Antwort.
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e)
Welche Bibliotheksplatte wird mit einer höheren Mutationsrate hergestellt? Begründen Sie Ihre Antwort.
Assay data from two library plates A and B. The values for internal controls are coloured in red.
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Wong, T., Tee, K. (2023). Hochdurchsatz-Screening (HTS). In: Ein praktischer Leitfaden für Protein Engineering . Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-031-32826-8_9
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DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-031-32826-8_9
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Publisher Name: Springer, Cham
Print ISBN: 978-3-031-32825-1
Online ISBN: 978-3-031-32826-8
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