八九民运精神导师、天体物理学家方励之教授遗体告别仪式4月14号下午四点在美国亚利桑那州图桑市举行。追悼会由方励之长子方克操办，家人希望方励之平静走完人生最后一程，告别仪式没有对媒体和公众开放。六四后流亡海外的学运和民运人士、方教授的学生、同事等共两百多人出席了告别仪式。方励之夫人李淑娴、胞妹、八九学运人士王丹及汉学家林培瑞，先后在丧礼上致悼词。而方励之任教的亚利桑纳大学，将另外择日为他举行追思会。
方励之夫人、前北京大学副教授李淑娴发表了追忆方励之的讲话，讲述了如何在政治磨难中与方励之相识相爱相守的经历。其中提到，1957年李淑娴被打成右派，方励之宁愿被开除中共党籍，也不放弃爱情。李淑娴并回顾了方励之生前几次因为敢言而招徕的险境，但“不让学生受伤害”始终是他不变的坚持。
八九学运领袖王丹日前在其脸书中写道，“明天的告别仪式，我送的花圈上的挽联，我不想绞尽脑汁地展现文采，我将简单地写上：‘从北大到美国，您是我始终的导师;由思想及为人，我是您永远的学生。’”
曾协助方励之夫妇在美国驻北京大使馆避难的美国汉学家林培瑞(Perry Link)教授表示，人们悼念方励之，要从人权、民主、科学的角度来为他“盖棺定论”。林培瑞对方励之的猝逝表示难以接受，他认为方励之真正的死因，绝对不会是“突然咳嗽一声就倒地”那么简单，方励之去年曾患两场大病，医生未能找出病因，后来不药而愈。
方励之生前在亚利桑纳大学物理系的同事们表示，方励之虽然人在美国，但一直心系中国，不遗余力地为中国培养天体物理学和宇宙学方面的人才。而他指导的大陆学者，发表论文时，常常因为政治原因而无法冠上方励之的名字。
在亚利桑纳大学任教40年的谢克强(Ke Chiang Hsieh)教授说，“方教授培养了中国大陆天体物理学和宇宙学的最新一代领袖。他花时间、花金钱，帮助、赞助大陆来的学生和学者。他们回到大陆都有出色表现，也和方教授有密切联络。”
谢克强还说，方励之去世当天早上，因身体不适请假，请假后即在家打开电脑和中国大陆科学家联络，“真的是鞠躬尽瘁，死而后已。”
和方励之同事9年的苏淑芳回忆初见方励之的印象是：“和以前想像的完全不一样。过去以为推动民运的人士，一定是慷慨激昂。但方教授完全是一位文人学者，谦谦君子、平易近人。对晚辈非常随和。和他在一起，感到如沐春风。科学典故，和科学有关的故事，他能随手拈来，娓娓道来，非常生动，如话家常。”
现在美国加州作访问学者的北京大学教授夏业良对美国之音表示，他代表北大部分教职工和校友向方励之教授献了花圈。夏业良认为，方励之先生所体现的民主科学精神，其影响不会因为他的去世而有所减少。他说：“今天其实更需要有像方先生这样的知识分子、教育者和科学家，能够从自己的知识分子的道义担当，为中国未来的发展并且能够为中华民族做出一些奉献。这种精神是特别值得倡导的。”
香港民众15号举行了纪念八九民运的23公里长跑活动。活动主办者香港支联会主席李卓人带领大家默哀一分钟，向八九民运的重要支持者方励之教授、胡耀邦以及在六四事件中的死难者表示哀悼。民主派议员梁耀忠代表众人在民主女神像以及方励之和胡耀邦的画像前敬献鲜花。
据苹果日报报道，熟悉方家朋友的人士透露说，由于方励之从未考虑身后之事，骨灰应埋在何处成了家人的难题。他生前好友和学生都知他在世时很想回国但归不得，但如果去世后重归故里，妻子李淑贤将如何回国扫墓?最终由家人决定让骨灰留在他生活了二十年的图桑，陪伴妻儿。李淑娴表示，骨灰未来是否迁葬回国，还得看当局的态度。
方励之4月6号在亚利桑那州图森市家中突然逝世，享年76岁。他曾任中国科技大学副校长，在1986年的学潮中支持学生的民主活动。1987年在中共的“反对资产阶级自由化运动”中被邓小平点名，开除党籍。1989年天安门学生运动中，方励之向时任中共中央军委主席的邓小平致公开信，要求释放民运人士。六四事件后，方励之夫妇前往美国驻华使馆寻求避难，半年后前往美国，并留在亚利桑那大学任教。
方励之的逝世引起世界各大媒体的关注。美国的主要报纸《华尔街日报》、《纽约时报》等都发表文章对他的故去表示惋惜，美国国务院并对方励之去世表达哀悼。法新社称方励之是“中国的萨哈罗夫”，法国的主要报纸《解放报》称方励之为中国民主运动的先驱，《世界报》把方励之称之为天安门精神之父。日本的《产经新闻》也发表评论，表示方励之所留下的民主化思想将获得继承。
美国之音指出，方励之逝世后的几个星期以来，六四后被迫流亡海外的中国学者、学生和民运人士争取回国权的唿声日益高涨。
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