Salk-Wissenschaftler entdecken das am häufigsten mutierte Gen bei allen Krebsarten

Salk-Wissenschaftler entdecken das am häufigsten mutierte Gen bei allen Krebsarten

Die Ergebnisse zeigen, dass einige der von der Medizin am häufigsten angegriffenen Mutationen nicht so häufig sind wie bisher angenommen

LA JOLLA – Seit fünfzehn Jahren verwenden Krebsforscher DNA-Sequenzierungstechnologie, um die Genmutationen zu identifizieren, die verschiedene Formen von Krebs verursachen. Nun, Salk-Assistenzprofessor Edward Stites und sein Team aus Computerwissenschaftlern haben Genmutationsinformationen mit Daten zur Krebsprävalenz kombiniert, um die genetische Grundlage von Krebs in der gesamten Population von Krebspatienten in den Vereinigten Staaten aufzudecken.

Die Studie, veröffentlicht in Nature Communications veröffentlicht am 13. Oktober 2021 zeigt, wie häufig jedes Gen im Genom bei Krebspatienten mutiert ist. Die Ergebnisse könnten dazu beitragen, die genetische Forschung bei der Entwicklung wirksamerer Behandlungen als derzeit verfügbar zu unterstützen.

„Das Papier beantwortet eine sehr grundlegende Frage: Welches sind die am häufigsten mutierten Gene bei menschlichem Krebs?“ sagt Stites, der auch Arzt und Inhaber des Entwicklungslehrstuhls der Hearst Foundation ist. „Überraschenderweise wurde diese Frage nicht beantwortet.“

Genetische Mutationen spielen eine grundlegende Rolle bei der Entstehung und dem Wachstum von Krebserkrankungen. Sie können auch gezielt für eine wirksame Behandlung eingesetzt werden. Obwohl in vielen Studien die Mutationen identifiziert wurden, die bei bestimmten Krebsarten wie Brustkrebs oder Lymphomen eine Rolle spielen, war es bisher noch niemandem gelungen, die Daten so zu kombinieren, dass sich herausstellen ließe, welche Mutationen in der gesamten Krebspatientenpopulation am häufigsten vorkommen. Jeder Krebs ist anders und daher ist es schwierig zu bestimmen, welche krebserregenden Gene und welche Angriffspunkte für Medikamente für weitere Untersuchungen priorisiert werden sollten.

In der neuen Studie kombinierte das Team von Stites Datensätze aus genomischen und epidemiologischen Krebsstudien, um zu bestimmen, bei welchem ​​Prozentsatz aller Krebspatienten ein Gen mutiert ist. Obwohl diese Aufgabe zunächst einfach schien, entdeckten sie bald, warum die Frage bisher nicht beantwortet wurde: Genomische und epidemiologische Studien verwenden kein gemeinsames Benennungssystem für die verschiedenen Krebsarten. Beispielsweise klassifizierten einige Forscher Krebserkrankungen nach ihrer Lokalisation am Körper, während andere sie nach Tumortyp gruppierten, und viele verwendeten eine Kombination aus beiden. Dies machte es schwierig, die Datensätze abzugleichen, was entscheidend für die Bestimmung der Häufigkeit der verschiedenen Mutationen war.

Um diese Herausforderung zu meistern, analysierten die Wissenschaftler sorgfältig mehr als 200 Studien und überprüften und klassifizierten jeden Krebs einzeln nach einem einheitlichen Benennungssystem neu. Anschließend verglichen sie die Datensätze und berücksichtigten dabei die Tatsache, dass einige Krebsarten häufiger auftreten als andere. Als sie die Daten analysierten, stellten sie fest, dass einige weit verbreitete Überzeugungen falsch waren. Beispielsweise ist KRAS ein wichtiges krebsförderndes Gen, von dem angenommen wurde, dass es bei 25 % aller Krebsarten mutiert ist; vielmehr wurde festgestellt, dass es nur an etwa 11 % aller Krebsarten beteiligt ist. Dies war Teil eines Trends, bei dem einzelne genetische Mutationen seltener vorkamen als bisher angenommen.

„Diese Ergebnisse verdeutlichen die Notwendigkeit, neu zu bewerten, worauf die Menschen ihre Zeit, Aufmerksamkeit und Ressourcen konzentriert haben“, sagt Stites. „Wir sollten die Forschungsbemühungen gleichmäßiger auf die verschiedenen genetischen Ursachen von Krebs verteilen, und wir sollten die Entwicklung neuer Krebsbehandlungen gleichmäßiger auf die verschiedenen wichtigen Behandlungsstrategien verteilen, da das Konzept, auf bestimmte Mutationen abzuzielen, weniger wirkungsvoll sein wird als bisher.“ angenommen worden.“

Weitere Autoren der Studie sind Gaurav Mendiratta, Meraj Aziz, David Liarakos und Melinda Tong von Salk und Eugene Ke von der University of Virginia.

Die Forschung wurde vom Pioneer Fund, den National Institutes of Health und der Melanoma Research Alliance unterstützt.

DOI: 10.1038 / s41467-021-26213-y